12月7日，吕秀莲被推举为民进党的代理党主席，吕秀莲担任了代理党主席后，发表了一系列言论，引起了民进党内部的不满。

　　吕秀莲先是表示要处理民进党党员林进兴的党纪问题，随后又前往高雄视察高雄地铁工程，宣布要成立民间监督联盟调查高雄地铁工程，吕秀莲还公开说是在替陈水扁看守民进党中央，并在11日召集民进党中常委和各派系领袖座谈。吕秀莲的一系列动作引起陈水扁的强烈不满。据台湾媒体报道说，陈水扁对吕秀莲的作法很生气，因此取消了他12日与吕秀莲的例行会晤。吕秀莲在12日也以健康原因取消了当天的全部活动。很多民进党重要人士表示，吕秀莲目前还不能获得民进党党员的信任，他们难以理解吕秀莲近期的一些作法。

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